廣西北投民航投資有限公司是國有資本控股公司，由廣西北部灣投資集團(tuán)76.00%和廣西機(jī)場(chǎng)管理集團(tuán)24.00%兩家廣西區(qū)直國企控股的公司，廣西北投民航投資有限公司對(duì)外投資的下屬公司有廣西北部灣航空有限責(zé)任公司（北部灣航空公司）。
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廣西北投民航投資有限公司董事長是由廣西北部灣投資集團(tuán)運(yùn)營部總經(jīng)理兼任的。
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北部灣航空公司由海航集團(tuán)（天津航空有限責(zé)任公司）控股70%和廣西北投民航投資有限公司控股30%的企業(yè)。